Iako je klinčić danas najviše poznat kao začin, on ima brojna ljekovita svojstva. Prema svojoj nutritivnoj vrijednosti klinčić je sličan cimetu.

Sadrži vlakna, fitosterole, kalcijum, željezo, magnezijum, fosfor, bakar, vitamine C, E, K i B6, folnu kiselinu. Klinčić sadrži eugenol, kariofilen, koji imaju jaka antimikrobna i antibakterijska svojstva, pa se upotrebljavaju u borbi s mnogim bakterijama i gljivicama. Klinčić je stimulans, lokalni antiseptik i blagi anestetik.

Ima pozitivne učinke na želučanu sluznicu, djeluje protiv povraćanja i nadutosti te potiče pravilan rad probavnog sistema. Mješavina ulja od susama i klinčića pomaže kod ublažavanja bolova koji se javljaju kod upale uha. Klinčić je ujedno poznati prirodni afrodizijak.